基于图像的高通量数据分析；图及复杂网络理论及其应用；生物信息学中蛋白质相互作用预测、药物靶点预测、microRNA与疾病关系预测、疾病相关的 miRNA-环境因子组合作用预测、非编码RNA大规模功能类似性网络构建等。
尤博士是IEEE会员，中国计算机学会CCF计算机应用专委会常委。
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